X上でアプリケーションを起動するには、以下の方法が用いられます。

1）パネル
画面下部または上部（カスタマイズ可能）に表示される、「パネル」と呼ばれるツールバーに表示されたアイコンをクリックします。
このパネルにあるアイコンは、「パネルの設定」で追加／削除が出来ます。

2）デスクトップ・アイコン
Windowsなどでは当り前のデスクトップ・アイコンですが、UNIXの世界では必ずしもあるとは限りません。むしろ、他の起動方法が充実しているため、デスクトップ上に邪魔なアイコンは必要ないとさえ言えます。

KDEの場合は、Konquerorを起動してプログラムのあるディレクトリに移動した後、アイコンをデスクトップにドラッグする事でショートカットアイコンを作成することが出来ます。

3）プログラムメニュー
パネル左端のアイコンをクリックすると現れるプログラムメニューから起動します。プログラムの場所を覚えていない場合はこれが便利です。
このメニューは、マウスの中ボタンを押すことでも表示されます。2ボタンマウスの場合は、左右ボタンを同時に押すことで中ボタンをエミュレートします。

4）コンソール
FreeBSD（と言うかXFree86)では、X上に起動するコンソールがいくつか用意されています。
デフォルトで実装されている"Xterm"や、日本語の使用が可能な"Kterm"などの他にも、ウィンドゥマネージャに付属する"Konsole(KDE console)"や"GNOME terminal"などが使用出来ますので、そこからコマンドでアプリケーションを起動します。

5) クィックターミナル
XFree86上で"Alt + F2"をタイプすると、プログラム起動用のクィックターミナルが開きます。ここにコマンドを入力してアプリケーションを起動することが出来ます。

（左下）kterm （中）クィックターミナル （右上）xterm

FreeBSDには、portsと呼ばれるアプリケーション群が存在します。その数はおよそ6,800にものぼり、しかもそれらは簡単にインストール出来て、すぐにでも使えます。

これは「スケルトン」と呼ばれるファイルセットで構成されており、それ自体がアプリケーションのソースコードを保有するものではありません。

通常、プログラムをソースコードからコンパイルしてインストールするには、とても手間のかかる退屈な作業が必要になります。portsはこれらの手間を省くために必要なMakefileなどを提供するもので、新しくインストールしたいプログラムに対応するportsのディレクトリに移動したら、# make でコンパイルし、# make installでインストールを行なうだけです。

もしもディスク領域に余裕があるならば、すべてのportsをダウンロードしておくと良いでしょう。サイズは解凍前で約15MBです。
適当なディレクトリにダウンロードしたら、rootでログインして、以下のようにして解凍しておきます。

# mv ports.tar.gz /usr
# tar zxvf ports.tar.gz
# rm ports.tar.gz

インストールは、対象のportsがあるディレクトリに移動して行ないます。その際には /usr/ports/distfiles が指示するソースファイルをネットワーク上から取得しますので、マシンがインターネットに接続されている必要があります。

例えば日本語の「丸文字フォント」をインストールするならば、portsは /usr/ports/japanese にありますので

# cd /usr/ports/japanese
# ls | grep marumoji
/usr/ports/japanese/marumoji-fonts
# cd marumoji-fonts

として、marumoji-fontsディレクトリに移動したあと、

# make

で必要なソースコードの検索とダウンロードが開始され、完了後すぐにコンパイルが自動的に始まります。そして、

# make install

でインストールが完了します。

プログラムは、再びプロンプト（# などの行頭の文字）が出た時にはもう使用できる状態になっています。UNIXでは、事あるごとに再起動する必要などありません。

探しているportsがどこにあるかわからない場合は、コンソールから # whereis コマンドで探すか、

# whereis proftpd
proftpd: /usr/ports/ftp/proftpd

または、portsコレクションの検索機能を使います。

# cd /usr/ports
# make serach key=(検索する文字列）

portsに関する更に詳しい情報を得るには、こちらのハンドブックをお読み下さい。

FreeBSDでは、パッケージになっているプログラムが数多くあります。これは上記のportsと違ってソースコードではなく、従ってコンパイルする必要がありません。

パッケージはFreeBSDのCD-ROMに収録されていますし、FTP経由でダウンロードする事も出来ます。

ただ、portsにはFreeBSDのヴァージョンは（本質的には）関係ありませんが、パッケージはインストールされているカーネルと同じヴァージョンのものを（下位互換はあるようですが）インストールする必要があります。パッケージだけを最新ヴァージョンのものに取り替えるという作業は避けた方がいいでしょう。

パッケージをインストールするには、

# /stand/sysinstall

から"Packages"で行なうか、

# pkg_add (パッケージ名）

で行なえます。